چارلز جان ماهونی (به انگلیسی: Charles John Mahoney) (زاده ۲۰ ژوئن ۱۹۴۰ – درگذشته ۴ فوریه ۲۰۱۸) یک هنرپیشه آمریکایی انگلیسی الاصل بود. او برای بازی در نقش مارتین کرین در سریال کمدی NBC Frasier (1993-2004) شناخته شد و در سال 2000 جایزه انجمن بازیگران سینما را برای این نقش دریافت کرد. ماهونی کار خود را در شیکاگو به عنوان عضوی از کمپانی تئاتر استپن ولف در کنار جان مالکوویچ، گری آغاز کرد. سینیز و لوری متکالف او در سال 1986 جایزه کلارنس درونت را بهعنوان امیدوارکنندهترین بازیگر مرد تازهوارد دریافت کرد. بعداً در همان سال، بازی او در احیای فیلم «خانه برگهای آبی» به کارگردانی جان گوار در برادوی، جایزه تونی بهترین بازیگر نقش اول مرد را برای او به ارمغان آورد.
ماهونی برای اولین بار با بازی در فیلم هایی مانند کمدی عاشقانه جان پاتریک شانلی (1987)، کمدی مردان حلبی ساخته بری لوینسون، درام ورزشی جان سایلس Eight Men Out (1988)، درام رمانتیک کامرون کرو، هر چیزی بگو… (1989) شناخته شد. بارتون فینک برادران کوئن (1991) و پروکسی هادساکر (1994)، کلینت ایستوود در خط آتش (1993) و رمان عاشقانه سیاسی راب راینر رئیس جمهور آمریکا (1995). او علاوه بر این در فیلمهای Antz (1998)، غول آهنین (1999)، آتلانتیس: امپراتوری گمشده (2001) و Kronk’s New Groove (2005) صداپیشگی کرد. در تلویزیون، ماهونی همچنین در Cheers، 3rd Rock from the Sun، ER، In Treatment، Hot in Cleveland و Foyle’s War ظاهر شد.